医療機関におすすめのシフト管理システム6選|夜勤・当直対応も紹介
更新日 2025年11月04日
医療機関では、医師・看護師・技師・事務職員など多職種の医療スタッフが勤務し、夜勤や当直、オンコールなど複雑な勤務体制を取っています。シフト作成や勤怠管理を部分的にシステム化していても、複数ツールの併用や手作業が残る場合には、入力ミスやシフトの偏り、残業超過といった課題が生じやすく、働き方改革への対応が難しいのが現状です。
そこで本記事では、医療現場の勤務形態に対応したSaaS型シフト管理システムを厳選して紹介します。夜勤・当直を考慮 した自動シフト作成や、複数拠点・多職種管理、法令順守機能など、医療機関ならではのニーズに対応したシステムを比較し、導入時のポイントも解説します。
医療機関でシフト管理が複雑化している理由

医療現場では多様な職種が連携して診療・ケアを提供しており、勤務体制も一般企業とは大きく異なります。ここからは、医療機関においてシフト管理が複雑化している主な要因を解説します。
夜勤や当直、オンコールなど多様な勤務形態
医療機関では、24時間体制で診療やケアを行うため、日勤・夜勤・当直・オンコールなど多様な勤務パターンが存在します。診療科や病棟によってシフトの構成や拘束時間も異なり、全職員の勤務を公平に調整することは容易ではありません。特に夜勤明けの休息時間や、オンコール待機後の勤務制限など、労働基準法や医師の働き方改革を踏まえた管理が求められます。
こうした複雑な条件を考慮しながらシフトを作成するには、担当者の経験や勘に頼らざるを得ない部分も多く、属人化やミスの温床となりやすいのが現状です。結果として、調整に時間がかかり、現場の負担が増す原因となっています。
職種ごとの勤務規定・手当体系の違い
医療機関では、医師や看護師、臨床検査技師、放射線技師、事務職員など、多職種が連携して業務を行っています。それぞれの職種で勤務規定や休憩時間、手当の算出方法が異なるため、シフト管理は複雑化しやすい傾向があります。
たとえば、夜勤手当の支給基準が看護師と医師で異なったり、技師職ではオンコール回数が評価項目に含まれるケースもあります。このようにルールが細分化されると、Excelや手作業では条件の抜け漏れや算定ミスが発生しやすくなります。さらに、複数の部署で勤務体系が異なる場合、統一的な管理が難しく、システム化の必要性が高まっています。
Excelや紙ベース管理におけるヒューマンエラーと残業リスク
現在でも一部の医療機関では、シフト表をExcelや紙で作成/管理をしているケースがあります。小規模な組織では一見効率的に思えますが、職員数や勤務パターンが増えるほど入力や修正の手間が増し、ヒューマンエラーが起こりやすくなります。
たとえば、夜勤回数の偏りや休日出勤の記録漏れなど、わずかなミスが勤務不均衡や残業超過につながることも少なくありません。また、勤怠情報を別システムで管理している場合はデータの整合性が取りづらく、労務管理全体の精度にも影響します。結果として、働き方改革や法令遵守を阻む要因にもなり得ます。
医 師の働き方改革や36協定対応など法令順守の必要性
2024年4月から、医師にも時間外労働の上限規制が適用され、勤務時間の適正管理が医療機関にとって喫緊の課題となっています。36協定(労使協定)の範囲内で勤務を調整し、過重労働を防ぐ仕組みが求められますが、医療現場では緊急対応や患者の急変など突発的な要因が多く、完全なコントロールは容易ではありません。
そのため、実労働時間を正確に把握し、時間外労働や連続勤務の状況をリアルタイムで確認できる体制が不可欠です。手作業での集計では限界があるため、法令対応を支援するシステムの導入が、リスク管理と医療の質維持の両立に直結します。
医療機関がシフト管理システムを導入するメリット

ここでは、医療機関がシフト管理システムを導入することで得られる主な利点を紹介します。夜勤や当直などの特殊な勤務形態を前提にした機能が多く、 業務効率化と法令対応の両立を実現できます。
夜勤・当直を考慮した自動シフト作成による業務効率化
医療機関では、夜勤や当直、オンコールなど勤務パターンが多岐にわたるため、シフト作成は非常に時間のかかる業務です。シフト管理システムを導入すると、スタッフの希望や勤務ルール、夜勤回数の上限などを条件として自動的にシフトを生成できます。これにより、手作業での調整や確認の手間が大幅に削減され、担当者の負担が軽くなります。
また、複数職種間のバランスを考慮しながら自動で勤務を割り当てるため、特定のスタッフに負担が集中しにくくなります。人為的なミスの防止にもつながり、限られた人員の中で効率的に運用できる体制を構築できます。結果として、管理者・現場双方の業務ストレスを減らし、生産性を高めることが可能です。
打刻データとの連動で勤怠集計・残業管理を自動化
シフト管理システムは、出退勤の打刻データと連携することで、勤怠集計や残業時間の管理を自動化できます。これまで手作業で行っていた勤務時間の照合や残業申請の確認をシステム上で自動処理できるため、集計ミスを防ぎ、管理業務の効率が大幅に向上します。
特に医療機関では、夜勤明けや当直明けなど変則的な勤務が多く、正確な勤務時間の把握が難しいケースもありますが、打刻データと連動させることで、実働時間を正確に記録できます。さらに、残業時間が一定基準を超えた際に自動アラートを出す機能を備えるシステムもあり、36協定や医師の働き方改革に対応した労務管理にも役立ちます。勤怠の透明性が高まることで、職員の納得感や信頼性も向上するでしょう。
複数職種・拠点間の人員配置を一元管理
医療法人や大規模病院では、病棟や診療科、関連施設など複数の拠点にスタッフが所属しており、各所の勤務状況を把握するのは容易ではありません。シフト管理システムを導入すれば、複数拠点や職種の勤務スケジュールを一元的に管理でき、どこに誰が勤務しているのかをリアルタイムで把握できます。これにより、急な欠員やシフト変更にも柔軟に対応でき、業務の継続性を確保できます。