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医療機関におすすめのシフト管理システム6選|夜勤・当直対応も紹介

更新日 2025年11月14日
医療機関では、医師・看護師・技師・事務職員など多職種の医療スタッフが勤務し、夜勤や当直、オンコールなど複雑な勤務体制を取っています。シフト作成や勤怠管理を部分的にシステム化していても、複数ツールの併用や手作業が残る場合には、入力ミスやシフトの偏り、残業超過といった課題が生じやすく、働き方改革への対応が難しいのが現状です。
そこで本記事では、医療現場の勤務形態に対応したSaaS型シフト管理システムを厳選して紹介します。夜勤・当直を考慮した自動シフト作成や、複数拠点・多職種管理、法令順守機能など、医療機関ならではのニーズに対応したシステムを比較し、導入時のポイントも解説します。
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医療機関におすすめのシフト管理システム6選

ここでは、医療機関の勤務形態や運用体制に合わせやすいシフト管理システムを6つ紹介します。夜勤・当直の自動割り当て、医師の時間外労働管理、複数拠点の統合管理などに対応するサービスを中心に選定しています。
ジョブカン勤怠管理

ジョブカン勤怠管理

株式会社DONUTS
出典:ジョブカン勤怠管理 https://jobcan.ne.jp/
参考価格
200
/ユーザー
トライアルあり
IT導入補助金対象

ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型勤怠管理システムで、シリーズ累計で20万社の導入実績を誇ります。

医療機関のシフト管理においては、日勤・夜勤・当直・オンコールといった多様な勤務パターンに対応できる点が大きな強みです。操作画面も直感的で、医師・看護師・技師・事務スタッフなど職種を問わずスムーズに運用開始できる点が評価されています。

夜勤明け休息の自動確保設定や複数回休憩を含む勤務パターンのシフト作成も可能。「様式9」など入院基本料の届け出帳票用データ出力機能も備えており、医療機関・病院が抱える勤怠・シフト課題と働き方改革対応のニーズを同時に満たすおすすめシステムです。

主な機能
  • ICカード打刻
  • PC打刻・Web打刻
  • 静脈認証打刻
  • GPS打刻(位置情報記録)
ADVANCE勤怠

ADVANCE勤怠

関彰商事株式会社
出典:ADVANCE勤怠 https://kintai.sekisho.biz/
参考価格
お問い合わせ
IT導入補助金対象

ADVANCE勤怠(Hospital Edition)は、関彰商事株式会社が提供する勤怠管理システムで、病院・施設の複雑な勤務体制に特化しています。

オプションにより、パブリッククラウドとプライベートクラウド、オンプレミスから選択でき、医療機関の規模・運用形態に応じて柔軟に展開できます。病院・介護支援システムとの連携機能や「様式9」の出力機能も備え、医療現場の専門要件に対応しています。

看護師長や事務担当、人事や給与部門まで、出退勤打刻から申請・承認・勤怠チェック・集計までを一元管理可能です。また、夜勤・宿直・交替制勤務など複雑な勤務設計に対して、勤務間インターバルや手当算定などの設定を行い、労務リスクの可視化・軽減を支援します。

主な機能
  • ICカード打刻
  • PC打刻・Web打刻
  • 静脈認証打刻
  • GPS打刻(位置情報記録)
Universal勤次郎

Universal勤次郎

勤次郎株式会社
出典:Universal勤次郎 https://www.kinjiro-e.com/uk-lp/
参考価格
お問い合わせ
IT導入補助金対象

Universal勤次郎は、株式会社大塚商会が提供する次世代型の勤怠管理システムで、特に「医師の働き方改革」に対応した医療機関導入実績があります。

医療・福祉業界特有の勤務体系(複数回打刻・夜勤・当直・自己研鑽時間)や、法令対応(勤務間インターバル・代償休息)などを標準機能として備え、医療現場の「見える化」「デジタル化」を促進します。

勤務シフトから実績、打刻データ、有休消化・常勤換算表・帳票(様式9等)までをワンストップで管理可能。表計算ソフトで作成された勤務表を取り込み、そのまま勤怠管理へ移行できる“実務からの移行”支援機能もあり、病院DXの推進に適しています。

主な機能
  • ICカード打刻
  • PC打刻・Web打刻
  • GPS打刻(位置情報記録)
  • 自動連携できる給与計算システムあり
CWS就業管理システム

CWS就業管理システム

インフォコム株式会社
出典:CWS就業管理システム https://service.infocom.co.jp/healthcare/ope/cws-lp/index.html
参考価格
お問い合わせ
トライアルあり

CWS就業管理システムは、インフォコム株式会社が医療機関専用に開発した勤怠管理パッケージで、医師・看護師・技師・事務といった多職種を通じた病院運用を支えます。

24時間・365日稼働する病院業務、日付を跨ぐ夜勤・当直・オンコール、入院基本料(様式9)関連帳票など、医療機関ならではの勤務管理要件に幅広く対応。また、電子カルテ・給与システム・看護勤務割システムとの連携実績も豊富です。

出退勤打刻から勤務表作成、申請・承認、時間外管理など、医療機関の複雑な労務管理を一括で処理できます。リアルタイムのチェック機能により、打刻漏れや入力ミスを検出し、総務部門の工数削減とコンプライアンス強化を実現します。

主な機能
  • ICカード打刻
  • PC打刻・Web打刻
  • 自動連携できる給与計算システムあり
  • 変形労働時間制への対応
Vicsell病院向け勤怠管理Ⅱ

Vicsell病院向け勤怠管理Ⅱ

株式会社SCP.SOFT
出典:Vicsell病院向け勤怠管理Ⅱ https://www.vicsell.jp/prg_kh.html
参考価格
お問い合わせ

Vicsell病院向け勤怠管理Ⅱは、株式会社SCP.SOFTが病院・介護施設向けに特化して開発した勤怠管理システムで、医療機関のシフト作成や打刻、帳票、連携対応に強みがあります。

最大9,999通りのシフトマスタ登録が可能で、部署ごとに設定した勤務パターンを効率的に運用できます。タイムレコーダー、顔認証、体温測定打刻などの多様な打刻手段に対応し、給与ソフト・電子カルテとの連携も備えています。

日勤、夜勤、宿直、オンコールなどを含む複雑な勤務形態のシフト作成、出退勤打刻の自動収集、有休管理・電子申請、様式9帳票の作成まで一元化。勤務実績のリアルタイム把握と給与計算とのスムーズな連携で、医療機関の勤怠運用を効率化します。

主な機能
  • ICカード打刻
  • 静脈認証打刻
  • シフトの作成機能
  • 時間外労働の上限超過アラート設定
TimePro-VG

TimePro-VG

アマノ株式会社
出典:TimePro-VG https://www.tis.amano.co.jp/product/?_gl=1*nrfkne*_ga*MTQ4OTUzMzU4MC4xNjc0Nzk2ODUy*_ga_5T17QFH4KM*MTY4Njg4MzYwMS42NS4xLjE2ODY4ODM2MDIuMC4wLjA.
参考価格
お問い合わせ

TimePro‑VGは、アマノ株式会社が提供する勤怠管理システムで、特に大規模病院や複数拠点を持つ医療法人での活用を視野に開発されています。

勤務日や週、月ごとに法定超過を自動計算する機能、ポジション別の自動シフト生成、勤務見込みデータからのアラート通知など多彩な機能を備え、医師・看護師・多職種・複数拠点の勤務を統合管理できます。

勤務実績と見込みをリアルタイムで集計し、部門や職種を跨いだ人員配置や残業抑制を支援。Excelライクな操作性で、導入後の定着も進みやすく、医療機関のバックオフィス業務を一本化して管理部門の負担軽減に貢献します。

主な機能
  • ICカード打刻
  • PC打刻・Web打刻
  • 静脈認証打刻
  • GPS打刻(位置情報記録)
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医療機関でシフト管理が複雑化している理由

医療機関のシフト管理のイメージ
医療現場では多様な職種が連携して診療・ケアを提供しており、勤務体制も一般企業とは大きく異なります。ここからは、医療機関においてシフト管理が複雑化している主な要因を解説します。

夜勤や当直、オンコールなど多様な勤務形態

医療機関では、24時間体制で診療やケアを行うため、日勤・夜勤・当直・オンコールなど多様な勤務パターンが存在します。診療科や病棟によってシフトの構成や拘束時間も異なり、全職員の勤務を公平に調整することは容易ではありません。特に夜勤明けの休息時間や、オンコール待機後の勤務制限など、労働基準法や医師の働き方改革を踏まえた管理が求められます。
こうした複雑な条件を考慮しながらシフトを作成するには、担当者の経験や勘に頼らざるを得ない部分も多く、属人化やミスの温床となりやすいのが現状です。結果として、調整に時間がかかり、現場の負担が増す原因となっています。

職種ごとの勤務規定・手当体系の違い

医療機関では、医師や看護師、臨床検査技師、放射線技師、事務職員など、多職種が連携して業務を行っています。それぞれの職種で勤務規定や休憩時間、手当の算出方法が異なるため、シフト管理は複雑化しやすい傾向があります。
たとえば、夜勤手当の支給基準が看護師と医師で異なったり、技師職ではオンコール回数が評価項目に含まれるケースもあります。このようにルールが細分化されると、Excelや手作業では条件の抜け漏れや算定ミスが発生しやすくなります。さらに、複数の部署で勤務体系が異なる場合、統一的な管理が難しく、システム化の必要性が高まっています。

Excelや紙ベース管理におけるヒューマンエラーと残業リスク

現在でも一部の医療機関では、シフト表をExcelや紙で作成/管理をしているケースがあります。小規模な組織では一見効率的に思えますが、職員数や勤務パターンが増えるほど入力や修正の手間が増し、ヒューマンエラーが起こりやすくなります。
たとえば、夜勤回数の偏りや休日出勤の記録漏れなど、わずかなミスが勤務不均衡や残業超過につながることも少なくありません。また、勤怠情報を別システムで管理している場合はデータの整合性が取りづらく、労務管理全体の精度にも影響します。結果として、働き方改革や法令遵守を阻む要因にもなり得ます。

医師の働き方改革や36協定対応など法令順守の必要性

2024年4月から、医師にも時間外労働の上限規制が適用され、勤務時間の適正管理が医療機関にとって喫緊の課題となっています。36協定(労使協定)の範囲内で勤務を調整し、過重労働を防ぐ仕組みが求められますが、医療現場では緊急対応や患者の急変など突発的な要因が多く、完全なコントロールは容易ではありません。
そのため、実労働時間を正確に把握し、時間外労働や連続勤務の状況をリアルタイムで確認できる体制が不可欠です。手作業での集計では限界があるため、法令対応を支援するシステムの導入が、リスク管理と医療の質維持の両立に直結します。

医療機関がシフト管理システムを導入するメリット

医療機関がシフト管理システムを導入するメリット
ここでは、医療機関がシフト管理システムを導入することで得られる主な利点を紹介します。夜勤や当直などの特殊な勤務形態を前提にした機能が多く、業務効率化と法令対応の両立を実現できます。

夜勤・当直を考慮した自動シフト作成による業務効率化

医療機関では、夜勤や当直、オンコールなど勤務パターンが多岐にわたるため、シフト作成は非常に時間のかかる業務です。シフト管理システムを導入すると、スタッフの希望や勤務ルール、夜勤回数の上限などを条件として自動的にシフトを生成できます。これにより、手作業での調整や確認の手間が大幅に削減され、担当者の負担が軽くなります。
また、複数職種間のバランスを考慮しながら自動で勤務を割り当てるため、特定のスタッフに負担が集中しにくくなります。人為的なミスの防止にもつながり、限られた人員の中で効率的に運用できる体制を構築できます。結果として、管理者・現場双方の業務ストレスを減らし、生産性を高めることが可能です。

打刻データとの連動で勤怠集計・残業管理を自動化

シフト管理システムは、出退勤の打刻データと連携することで、勤怠集計や残業時間の管理を自動化できます。これまで手作業で行っていた勤務時間の照合や残業申請の確認をシステム上で自動処理できるため、集計ミスを防ぎ、管理業務の効率が大幅に向上します。
特に医療機関では、夜勤明けや当直明けなど変則的な勤務が多く、正確な勤務時間の把握が難しいケースもありますが、打刻データと連動させることで、実働時間を正確に記録できます。さらに、残業時間が一定基準を超えた際に自動アラートを出す機能を備えるシステムもあり、36協定や医師の働き方改革に対応した労務管理にも役立ちます。勤怠の透明性が高まることで、職員の納得感や信頼性も向上するでしょう。

複数職種・拠点間の人員配置を一元管理

医療法人や大規模病院では、病棟や診療科、関連施設など複数の拠点にスタッフが所属しており、各所の勤務状況を把握するのは容易ではありません。シフト管理システムを導入すれば、複数拠点や職種の勤務スケジュールを一元的に管理でき、どこに誰が勤務しているのかをリアルタイムで把握できます。これにより、急な欠員やシフト変更にも柔軟に対応でき、業務の継続性を確保できます。
また、拠点ごとの勤務実績や人員配置の偏りをデータとして分析できるため、経営判断や人材配置計画にも活用可能です。紙やExcelでは難しかった「全体最適の視点」でのマネジメントが実現し、医療サービスの質向上にもつながります。

勤務実績の可視化によるスタッフ間の公平性向上

医療現場では、夜勤回数や当直の負担が一部のスタッフに偏ることで不満が生じることがあります。シフト管理システムを導入すると、勤務実績や夜勤回数、残業時間などがデータとして可視化され、全スタッフの勤務状況を公平に確認できます。管理者はシステム上で勤務の偏りを把握しやすくなり、適切な調整や改善策を講じることが可能です。
また、スタッフ自身も自分や同僚の勤務状況を確認できるため、透明性が高まり、職場全体の納得感が向上します。こうした「見える化」は、人事評価やキャリア支援の基礎データとしても活用でき、職員間の信頼関係の構築にも寄与します。結果として、働きやすく公平な職場づくりを後押しします。
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「勤怠管理システム」との違いと医療現場での使い分け方

医療機関では、「勤怠管理システム」と「シフト管理システム」が混同されがちですが、目的と役割は大きく異なります。勤怠管理システムは、出退勤や休憩、残業などの実際の勤務実績を正確に記録し、労務管理や法令遵守を目的とする仕組みです。一方のシフト管理システムは、夜勤や当直、非常勤勤務などの勤務予定を事前に計画・調整するためのツールです。
シフト管理システムでは、看護師や医師の勤務希望をもとに自動でシフトを作成でき、夜勤回数の偏りや休日勤務の公平性を可視化できます。対して勤怠管理システムは、その実績を基に「勤務時間の把握」「残業上限のチェック」「様式9の自動出力」などを行います。つまり、シフト管理は「予定の設計」、勤怠管理は「実績の記録」という関係です。
医療機関ではこの2つを連携させることで、勤務予定と実績のズレを自動で検出し、労務リスクを低減できます。たとえば、シフト上は休日でも実際に呼び出し勤務が発生した場合、その情報が勤怠データに反映され、残業や時間外労働として正確に集計されます。
シフト作成の効率化だけでなく、働き方改革対応や公的帳票出力まで見据えるなら、両システムを統合的に運用できるサービスを選ぶことが重要です。「ジョブカン」や「KING OF TIME」など、シフト・勤怠を一元管理できるシステムも医療現場では注目されています。

比較項目

勤怠管理システム

シフト管理システム

以下の記事では、医療機関におすすめの勤怠管理システムをご紹介しています。シフト管理システムとあわせて確認してみてください。
医療機関におすすめの勤怠管理システム7選|病院・クリニックへの導入ガイド
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医療機関向けシフト管理システムの選び方

医療機関向けシフト管理システムの選び方
ここからは、医療機関がシフト管理システムを選定する際に確認すべきポイントを解説します。夜勤や当直などの複雑な勤務形態に柔軟に対応できるかどうかが、導入効果を左右します。

夜勤や当直スケジュールを柔軟に設定できるか

医療機関の勤務体制は、一般企業とは異なり夜勤や当直、オンコールなど多様な勤務形態を組み合わせて運用されています。そのため、シフト管理システムを選ぶ際は、夜勤・当直スケジュールを柔軟に設定できるかが重要です。
たとえば、夜勤明けの休息日数を自動的に確保したり、連続勤務を制限したりする機能があると、法令順守とスタッフの健康維持の両立が可能になります。また、医師や看護師など職種ごとの勤務パターンをテンプレート化できるシステムなら、作成業務をさらに効率化できます。現場ごとの勤務ルールや運用実態を細かく反映できる設計かどうかを、導入前に確認しておくことが大切です。

医療特有の手当や勤務区分に対応しているか

医療機関では、夜勤手当や当直手当、オンコール待機手当など、一般業種にはない独自の支給ルールが多数存在します。シフト管理システムを導入する際は、こうした医療特有の手当や勤務区分を正確に反映できるかを必ず確認しましょう。
たとえば、勤務時間帯によって支給金額が変動する場合や、休日夜勤の手当を別扱いにする場合など、細かな条件設定が必要になるケースは多くあります。設定の自由度が高いシステムであれば、給与計算との整合性を保ちながら正確な勤怠データを出力できます。結果として、経理・人事部門の作業負担も軽減され、ミスのない支給管理につながります。

勤怠・給与・人事システムと連携できるか

シフト管理システムを導入しても、他の業務システムと連携できなければ、データの二重入力や転記ミスが発生し、かえって効率が落ちることがあります。医療機関では勤怠・給与・人事評価など複数のシステムを利用していることが多いため、連携性は必須条件といえるでしょう。
API連携やCSV出力など、既存システムとの互換性が高い仕組みを備えたシステムを選ぶことで、情報の一元管理が可能になります。また、電子カルテや勤務実績管理システムとの連携により、勤務データを医療安全や人員配置計画にも活用できるケースがあります。将来の拡張性も見据え、接続可能な範囲を確認しておくと安心です。

法令・働き方改革対応(医師の時間外上限管理など)が可能か

システム選定時には、勤務時間の自動集計や上限アラート通知など、働き方改革を支援する機能が備わっているかを確認しましょう。また、時間外労働の限度を超える前に警告を出す機能や、休日労働・連続勤務日数の管理機能があると、コンプライアンスリスクの低減に効果的です。
法改正へのアップデート対応が迅速なベンダーを選ぶこともポイント。法令順守をシステムで仕組み化することが、安全で持続可能な医療提供体制の実現につながります。

導入や運用サポート体制が充実しているか

システムの導入は、機能面だけでなく「サポート体制の質」も大切です。導入時の初期設定やマスタ登録を丁寧に支援してくれるか、運用開始後の問い合わせ対応が迅速かどうかは必ず確認すべき点です。
特に医療機関では、シフト作成や勤怠管理を行う担当者が限られている場合が多く、トラブル対応を自力で解決するのは困難です。専任担当者による導入支援や定期的な運用フォロー、法改正時の設定サポートなどがあると安心です。
また、マニュアルやFAQが充実しているシステムなら、現場スタッフの定着も早まります。長期的な運用を見据え、ベンダーのサポート品質を重視して選定しましょう。
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シフト管理システムの導入成功のためのステップと注意点

シフト管理システムの導入時は、単に導入するだけでなく、現場の運用フローやルール整備を同時に見直すことが重要です。ここからは、導入を円滑に進めるためのステップを解説します。

現行の勤務体制や勤務区分の棚卸しを行う

導入前にまず行うべきは、現在の勤務体系や手当の種類、勤務区分の整理です。現状を正確に把握しなければ、システム設定の初期段階で不整合が発生するリスクがあります。
たとえば、夜勤手当やオンコール待機手当の算出ルールが職種や部署で異なる場合、事前に条件を統一しておくことで運用開始後の混乱を防げます。この棚卸しを通じて「属人化していた管理を可視化する」ことができ、業務効率化にもつながります。

現場スタッフへの説明やトライアル運用を行う

新しいシステムを導入する際は、現場スタッフの理解と協力が不可欠です。説明会やマニュアルの配布だけでなく、一定期間のトライアル運用を実施し、操作感や運用負担を確認しましょう。
特に医療機関では、夜勤・当直など時間帯が多様なため、全員が同条件で使えるよう配慮が必要です。導入前に課題を洗い出すことで、正式運用後のトラブルを最小限に抑えられます。

他システム(人事・給与・電子カルテ)との連携設計

勤怠やシフトの情報は、給与計算・人事評価・電子カルテシステムなどと密接に関連しています。導入時には、これらの既存システムとのデータ連携方法を明確に設計しておくことが重要です
連携がスムーズに行えれば、入力の二重作業やデータの齟齬を防ぎ、管理業務の負担を大幅に軽減できます。クラウド型のシステムであればAPI(他サービスとの接続機能)を利用して効率化を図るケースも増えています。

運用開始後のモニタリングと改善サイクル構築

導入後も定期的にシフト運用の状況を振り返り、改善サイクルを回すことが欠かせません。勤務時間や残業時間のデータを定期的に分析し、偏りや過重労働がないかをチェックしましょう。
また、スタッフからのフィードバックを受けて設定ルールを見直すことで、より公平で効率的な勤務体制を実現できます。このようにPDCA(計画→実行→評価→改善)を回す仕組みを組み込むことが、長期的な運用成功につながります。

まとめ|夜勤・当直対応まで見据えたシフト管理システムを選定しよう

医療機関のシフト管理は、夜勤・当直・オンコールといった多様な勤務形態が絡み合うため、属人的な対応では限界があります。シフト管理システムを導入すれば、自動作成や勤怠連携によって業務負担を軽減し、勤務偏りや残業超過を防止できます。
さらに、勤務データの可視化によりスタッフ間の公平性が高まり、離職防止や職場満足度の向上にもつながります。選定時は、医師の働き方改革や36協定に対応しているか、夜勤・手当区分など医療特有の条件を柔軟に設定できるかを確認することが重要です。
また、導入後も定期的に運用状況を見直し、現場の声を反映しながら改善を重ねることで、持続的に機能する仕組みが築けます。医療現場の実情に合ったシステムを選び、働きやすい環境づくりを進めましょう。
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著者
業界DX最強ナビ編集部
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