教育業界におすすめの勤怠管理システム12選|教育機関や学校に向けた選び方も紹介
更新日 2026年01月23日
教職員の長時間労働は、教育の質や 持続可能性を左右する喫緊の構造的課題です。給特法の抜本的な見直しや労働基準法の厳格化に伴い、教育現場にはこれまで以上に客観的かつ精緻な勤務時間の把握が求められています。しかし、一年単位の変形労働時間制や部活動に伴う不規則な勤務体系など、学校特有の労務管理は汎用的なシステムでは対応が困難な側面も少なくありません。
本記事では、最新の法規制を遵守しつつ、校務の効率化と教職員のウェルビーイングを両立させるための勤怠管理システムを厳選して紹介します。選定基準から各システムの特性まで、学校運営の最適化に資する情報を体系的に解説します。ぜひ参考にしてください。
学校特有の複雑な勤務形態を管理するには、現場のニーズに応える機能を備えたシステムの選定が不可欠です。ここからは、教育現場での活用に適したおすすめの勤怠管理システム12選をご紹介します。
勤怠先生
株式会社アットシステム
出典:勤怠先生 https://ekintai.jp/
勤怠先生は、教育機関での利用を想定して設計されたクラウド型の勤怠管理システムで、株式会社アットシステムが提供しています。教員・事務職員など多様な職種が在籍し、年間変形労働時間制や独自の勤務ルールを採用する学校現場においても、安定した勤怠管理を実現します。
長期休業 期間と学期中で勤務時間が大きく変動する教育機関特有の働き方に柔軟に対応できる点が大きな特徴。日常の出退勤管理に加え、時間外労働や休日出勤を正確に集計でき、教員の働き方改革や労働基準法改正を見据えた運用にも適しています。
ICカードやPCログによる打刻、勤怠実績の自動集計、残業時間のアラート通知、給与計算用データの出力などを備え、教職員の入力負担を抑えながら事務部門の業務効率化を支援。教育現場の実態に即した労務管理を実現したい学校法人に適した勤怠管理システムです。
ジンジャー勤怠
jinjer株式会社
出典:ジンジャー勤怠 https://hcm-jinjer.com/kintai/
ジンジャー勤怠は、jinjer株式会社が提供するクラウド型の勤怠管理システム。学校法人や教育機関における複雑な勤務管理にも柔軟に対応できます。教員・事務職員・非常勤講師など多様な雇用形態を一元管理でき、教育現場の実態に即した運用が可能です。
年間変形労働時間制やシフト制勤務に対応しており、長期休業期間と学期中で勤務時間が変動する学校特有の働き方も正確に管理できます。残業時間が一定基準を超えた際のアラート機能により、教職員の過重労働を未然に防ぐ点も特長です。
PC・ICカード・スマートフォンなど多様な打 刻方法に対応し、勤怠データは自動集計が可能。給与計算ソフトとの連携やCSV出力にも対応しており、教職員の負担軽減と事務部門の業務効率化を同時に実現したい教育機関に適しています。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
KING OF TIME
株式会社ヒューマンテクノロジーズ
出典:KING OF TIME http://www.kingtime.jp/
KING OF TIMEは、株式会社ヒューマンテクノロジーズが提供するクラウド型勤怠管理システムで、学校法人を含む幅広い業種で豊富な導入実績を持っています。教育機関における多様な勤務形態や厳格な労務管理にも対応できる高い汎用性が強みです。
年間変形労働時間制やシフト制勤務に対応しており、教員の繁忙期・閑散期を考慮した勤怠管理が可能。時間外労働の自動集計やアラート機能により、教職員の働き方改革や法令遵守を支援します。
ICカード、PCログ、スマートフォンなど豊富な打刻手段を備え、勤怠データは給与計算ソフトと連携可能。大規模な学校法人から単独校まで、安定した勤怠管理体制を構築したい教育機関におすすめのシステムです。
主な機能
- 勤務希望・休み希望の収集
- ICカード打刻
- 提出のリマインド
- PC打刻・Web打刻
ジョブカン勤怠管理
株式会社DONUTS
出典:ジョブカン勤怠管理 https://jobcan.ne.jp/
ジョブカン勤怠管理は、株式会社DONUTSが提供するクラウド型の勤怠管理システムで、学校法人や教育機関でも導入実績を持つサービスです。教員・事務職員・非常勤講師など、雇用形態が異なる職員をまとめて管理でき、教育現場の多様な勤務実態に対応します。
年間変形労働時間制やシフト制勤務に対応しており、学期中と長期休業期間で勤務時間が変動する学校特有の働き方も正確に管理可能。時間外労働や休日出勤の集計を自動化でき、教員の働き方改革や法令遵守を支援します。
また、ICカード、PC、スマートフォンなど複数の打刻方法に対応し、勤怠データは給与計算ソフトとの連携やCSV出力が可能。操作性にも定評があり、ITに不慣れな教職員が多い学校でもスムーズに定着しやすい勤怠管理システムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
freee勤怠管理Plus
freee株式会社
出典:freee勤怠管理Plus https://www.freee.co.jp/time-tracking-plus/
freee勤怠管理Plusは、freee株式会社が提供するクラウド型の勤怠管理システムで、学校法人のバックオフィス業務を効率化したい教育機関に適しています。シンプルな画面設計と自動化機能により、教職員・事務部門双方の負担軽減を実現します。
出退勤や休憩時間の記録、時間外労働の自動集計に対応しており、教員の長時間労働を可視化できます。年間変形労働時間制にも対応し、学校独自の勤務ルールを反映 した勤怠管理が可能です。
また、給与計算ソフトとのスムーズな連携により、勤怠データをそのまま給与処理へ反映でき、転記作業や入力ミスを防止します。紙やエクセル管理から脱却し、業務効率と透明性を高めたい教育機関に向いたシステムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
マネーフォワード クラウド勤怠
株式会社マネーフォワード
出典:マネーフォワード クラウド勤怠 https://biz.moneyforward.com/attendance
マネーフォワード クラウド勤怠は、株式会社マネーフォワードが提供するクラウド型の勤怠管理システムで、学校法人を含む多様な組織 の労務管理を支援しています。教育現場における複雑な勤務体系にも柔軟に対応できる点が特長です。
年間変形労働時間制やシフト制勤務に対応しており、学期ごとの繁忙期・閑散期を考慮した勤怠管理が可能です。残業時間や労働時間の上限を可視化でき、教員の働き方改革をデータ面から支援します。
打刻データは自動集計され、給与計算や会計ソフトとAPI連携が可能です。勤怠管理からバックオフィス業務まで一体で効率化したい学校法人に適した勤怠管理システムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
ハーモス勤怠
株式会社ビズリーチ
出典:ハーモス勤怠 https://hrmos.co/kintai/
ハーモス勤怠は、株式会社ビズリーチが提供するクラウド型勤怠管理システムで、教育機関における多様な勤務体系に対応しています。教員・事務職員・非常勤講師など複数の雇用形態を一元管理でき、教育現場の実態に即した勤怠管理が可能です。
年間変形労働時間制やシフト制勤務に対応し、学期ごとの繁忙期・閑散期を考慮した勤務管理を実現。残業時間の自動集計やアラート機能により、長時間労働の傾向を早期に把握でき、働き方改革の推進にも役立ちます。
打刻方法はPC・ICカード・スマートフォンに対応し、勤怠データは給与計算ソフトへの連携やCSV出力が可能です。帳票作成や承認ワークフローも備えており、事務作業の効率化を図りたい学校法人におすすめの勤怠管理システムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打 刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
キンコン
株式会社ソウルウェア
出典:キンコン https://www.kincone.com/
キンコンは、株式会社KINCONNEXが提供するクラウド型勤怠管理システムで、学校現場の複雑な労働時間管理にも対応しています。教員や事務職員の多様な勤務パターンを柔軟に反映でき、年間変形労働時間制やシフト制勤務にも適した設計です。
教員の出退勤・休憩時間の記録や時間外労働の自動集計が可能で、繁忙期と閑散期のバランスを可視化できます。基準値を超えた際のアラート機能により、過重労働対策としても有効です。
PC・スマートフォン・ICカードなど複数の打刻方法に対応し、給与計算ソフトとの連携やCSV出力でバックオフィス業務を効率化できます。教育機関特有の労務管理ニーズに応える、柔軟性の高い勤怠管理システムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
AKASHI
ソニービズネットワークス株式会社
出典:AKASHI https://ak4.jp/
AKASHIは、株式会社ヒューマンテクノロジーズが提供するクラウド型勤怠管理システムで、教育機関における労務管理を支援します。教員・事務職員・非常勤講師など多様な雇用形態を一元管理でき、年間変形労働時間制やシフト制勤務にも対応す る設計です。
出退勤や休憩時間の打刻はPC・スマートフォン・ICカードなどから行え、勤怠データは自動集計されます。残業時間や深夜勤務の集計、アラート通知機能により、教員の働き方改革や法令遵守を支援します。
勤怠データは給与計算ソフトとの連携やCSV出力が可能で、事務部門の作業負担を軽減します。教育現場の実態に合わせて柔軟に設定できるため、学校法人の勤怠管理基盤として導入しやすいシステムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 静脈認証打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
e3school 勤怠管理システム
株式会社システムリサーチ
出典:e3school勤怠管理システム https://e3school-kintai.com/
e3school勤怠管理システムは、株式会社エデュースが提供する、学校法人向けに設計さ れた勤怠管理システムです。校務支援システム「e3school」シリーズの一機能として、教育現場の業務フローを前提にした勤怠管理を実現します。
教員・事務職員・非常勤講師など、雇用形態の異なる職員をまとめて管理でき、年間変形労働時間制や学校独自の勤務区分にも対応しています。学期中と長期休業期間で勤務時間が変動するケースでも、実態に即した勤怠把握が可能です。
出退勤や休憩時間の記録、勤怠データの自動集計、帳票出力に対応しており、校務支援システムと連携した一元管理が行えます。勤怠管理を校務全体の効率化につなげたい学校法人に適したシステムです。
楽楽勤怠
株式会社ラクス
出典:楽楽勤怠 https://www.rakurakukintai.jp/
楽楽勤怠は、株式会社ラクスが提供するクラウド型の勤怠管理システムで、学校法人や教育関連施設の勤怠管理にも活用されています。操作性のわかりやすさに定評があり、ITに不慣れな教職員が多い現場でも導入しやすい点が特長です。
出退勤・休憩時間の打刻や時間外労働の自動集計に対応し、教員の長時間労働を可視化できます。年間変形労働時間制にも対応しており、学期ごとの繁忙期・閑散期を考慮した勤怠管理が可能です。
勤怠データはCSV出力や給与計算ソフトとの連携ができ、事務部門の転記作業や集計負担を軽減します。紙やエクセル管理から脱却し、確実かつ効率的な勤怠管理を実現したい教育機関に適したシステムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- 自動連携できる給与計算システムあり
- フレックスタイム制への対応
MOT勤怠管理
株式会社バルテックITソリューションズ
出典:MOT勤怠管理 https://mot-kintaikanri.net/
MOT勤怠管理は、株式会社バルテックが提供するクラウド型の勤怠管理システムで、学校法人や教育機関の多様な勤務実態にも対応できます。教員・事務職員・非常勤講師など多様な職種を一元管理でき、教育現場の複雑な労務管理も効率化します。
出退勤の打刻はスマートフォン・PC・ICカードなど多様な方法で行え、直行直帰や校外研修など場所を問わず正確に記録できます。また、打刻漏れ防止のアラートや残業時間の集計、自動集計機能を備えており、学期中の繁忙期と長期休業期間の変動にも柔軟に対応が可能です。
教育機関特有の年間変形労働時間制の管理にも活用でき、教職員の働き方改革を支援。勤怠データはCSV出力や給与ソフト連携も可能で、事務作業の負担を大幅に軽減できます。教育現場における正確な勤怠管理とバックオフィス業務の効率化を同時に実現したい学校法人に適したシステムです。
主な機能
- ICカード打刻
- PC打刻・Web打刻
- GPS打刻(位置情報記録)
- 自動連携できる給与計算システムあり
なぜ今、教育機関・学校に勤怠管理システムが必要なのか?

日本の教育現場は、深刻な教員不足と長時間労働の是正という大きな転換期を迎えています。これまで「教育の聖職性」を理由に曖昧にされてきた教職員の労働時間は、今や厳格な管理が求められる時代となりました。
2026年の労働基準法改正への対応も含め、なぜ今デジタルによる可視化が急務なのか、その背景にある構造的な課題を詳しく紐解いていきましょう。ここからは、勤怠管理システムの具体的な必要性の背景をご紹介します。
教職員の働き方を見直す上で、給特法(公立学校教職員給与特別措置法)の改正議論に基づいた在校等時間の可視化は避けて通れません。現行制度では残業代が支払われない代わりに「教職調整額」が支給されていますが、実態に即した処遇改善を進めるためには、勤怠管理システム等を活用した客観的な勤務時間の把握が絶対条件となります。
文部科学省も指針を示しており、手書きの出勤簿ではなく、ICTを活用した正確な記録が強く推奨されています。例えば、横浜市などの自治体では、ICカード連動型の勤怠管理システムを導入し、月45時間を超える時間外勤務を「見える化」することで、業務改善の端緒として活用しています。
法律の枠組みが大きく変わろうとしている現在、まずは現状を正しく把握することが重要な第一歩です。将来的な制度変更を見据え、勤怠管理システムを通じて「いつ・誰が・どれだけ働いているか」を客観的に証明できる環境を整える必要があります。
学校特有の課題である部活動や学校行事による不規則な勤務管理を適正化するために、勤怠管理システムの導入は極めて有効です。放課後の指導や休日の引率など、教員の業務は一般的なオフィスワークと異なり、時間的・場所的な制約が複雑に入り組んでいるためです。
従来のタイムカードでは、こうした変則的な勤務を正確に記録しきれず、結果として「隠れ残業」が常態化する要因となっていました。実際の事例として、東京都の私立学校では、部活動の遠征先からスマートフォンでGPS打刻ができるシステムを採用し、適正な休日手当の算出に成功しています。
不透明になりがちな教員の時間外労働を透明化することは、教職員を守ることと同義だといえるでしょう。学校現場の実態に即した柔軟な記録方法を持つシステムを導入し、複雑な労働実態を整理することが大切です。
2026年に施行される労働基準法改正により、教育現場においても、勤怠管理システムを前提とした厳格な労働時間管理とコンプライアンス対応が求められるようになります。法改正の目的は、さらなる長時間労働の是正と健康確保にあり、企業だけでなく学校法人に対しても、これまで以上に重い法的責任が課される見通しです。
これまで「努力義務」に近い扱いだった項目が、罰則を伴う義務へと強化される可能性がある中、手作業による管理にはすでに限界があります。例えば、産業医との連携が必要となる「月100時間超の残業」を、勤怠管理システムで正確に把握できていない場合、安全配慮義務違反として訴訟リスクに発展する恐れもあります。
法改正への対応は直前になって慌てるのではなく、早期に体制を整えておくことが重要です。2026年の新基準へスムーズに移行するためにも、勤怠管理システムを活用したログベースの正確な管理体制を、今のうちから構築しておきましょう。
失敗しない!教育機関がシステムを選ぶ際の4つのポイント

多忙な教育現場において、システム導入自体が新たな負担になっては本末転倒です。学校特有の勤務形態や既存のICT環境との親和性を考慮し、現場の教職員が直感的に使いこなせるツールを選ぶことが成功の鍵を握ります。
選び方を間違えると、データの二重入力や集計ミスといったトラブルを招く恐れがあるため注意が必要。ここからは、失敗しないための具体的な選定ポイントをご紹介します。
教育機関向けの勤怠管理システムでは、1年単位の変形 労働時間制に十分対応しているかが重要な選定ポイントです。学校では、夏休みなどの長期休業期間は勤務時間を短縮し、学期中の繁忙期に長く設定するなど、年間を通じた勤務時間調整が一般的に行われます。
この制度は計算が複雑なため、対応が不十分なシステムではエクセルでの再計算が必要となり、かえって業務負担が増える恐れがあります。自校のシフトパターンを事前に登録し、過不足時間を自動計算できるかを、デモ画面などで必ず確認しましょう。
客観的な打刻手段の豊富さ(PCログ・ICカード等)
勤怠管理では、PCのログイン・ログアウト履歴やICカードなど、客観的な記録を残せる多様な打刻手段を備えたシステムを選ぶことが重要です。労働基準法では、使用者に労働時間を客観的に把握する義務があり、自己申告のみに依存した管理は望ましくありません。
特に教員は、職員室でのPC作業に加え、教室や屋外での業務も多いため、打刻方法が一つに限られると正確な記録が難しくなります。実際には、校門でのICカード打刻とPCログを組み合わせ、実労働時間を精緻に把握している学校もあります。スマートフ ォンのGPS打刻なども含め、自校の動線に合った打刻方法を柔軟に選べるかが、運用定着の鍵となります。
校務支援システムや給与計算ソフトとのデータ連携機能は、事務作業を自動化するうえで欠かせません。勤怠データが独立していると、給与計算時に手入力の転記作業が発生し、入力ミスや残業時間の誤認につながる恐れがあります。
システム連携が円滑であれば、打刻データをそのまま給与ソフトへ反映でき、毎月の集計業務を大幅に短縮できます。導入検討時には、現在利用中の校務支援ソフトとCSV出力などで問題なく連携できるかを、事前にベンダーへ確認しておきましょう。
教職員の健康を守るためには、残業時間が上限に近づいた際に自動通知するアラート機能が重要です。多忙な教員は自身の累積労働時間を把握しにくいため、管理者が早期に状況を把握し、業務調整に介入する仕組みが求められます。
例えば、「月30時間超過」などの基準で本人や管理職へ通知が届けば、長時間労働が深刻化する前に対策を講じることが可能です。クラウド型勤怠システムでは、リスクのある職員をダッシュボードで可視化でき、メンタルヘルス不調の予防にも役立っています。アラート通知は時間意識の醸成にもつながり、事後対応ではなく予防型の労務管理を実現します。
勤怠管理システムの導入が教育現場にもたらすメリット

勤怠管理システムの導入は、単なる管理の厳格化に留まらず、学校経営そのものを健全化する大きなメリットをもたらします。アナログな管理から脱却することで生まれる余剰時間は、最終的に児童生徒と向き合うための質の高い教育時間へと還元されるはずです。また、組織としての透明性が高まることで、教職員が安心して働ける環境が整います。
ここからは、導入によって得られる具体的なメリットをご紹介します。
管理職・事務部門における校務プロセスの最適化とリソースの再配分
勤怠管理の自動化は、管理職や事務部門の校務プロセスを最適化し、人的リソースを教育支援へ再配分することができます。これまで手書き書類の回収や集計に費やされていた多くの工数は、システム導入により大幅な削減が可能です。
事務職員が転記作業などの定型業務から解放されることで、学校独自の教育プログラム支援や広報活動といった、より付加価値の高い業務に注力できる環境が整います。実際、ある私立学校では業務効率化によって生まれた時間を、ICT環境の整備や奨学金制度の充実に充て、学校全体の競争力向上につなげました。
非効率な事務負担を見直し、余剰リソースを教育現場の本質的な課題へ投資することは、学校経営の質を高め、組織の持続的な発展を支える重要な戦略といえるでしょう。
蓄積された勤怠データは、主観を排した客観的なエビデンスとして、実効性のある働き方改革を推進する重要な基盤となります。単なる「忙しい」という感覚的な訴えではなく、具体的な数値に基づいて業務の優先順位や配分を見直すことで、学校運営を客観的に改善できる ためです。
会議の頻度や行事準備に要する時間を数値として可視化すれば、教職員間の不公平感の解消にもつながります。実際に埼玉県などの自治体では、勤務実態調査のデータを活用し、部活動ガイドラインの策定や学校行事のスリム化を進め、着実な残業時間削減を実現しています。
信頼性の高いデータがあれば、保護者や教育委員会に対する業務削減の説明や交渉も、より論理的に進めることが可能です。働き方改革を単なるスローガンで終わらせないためにも、客観的データを経営判断の材料とし、実効性ある改善策を講じていきましょう。
適正な時間管理は、教職員のウェルビーイングを高め、喫緊の課題である離職防止に大きく貢献します。勤務実態が正しく把握・評価され、十分な休息が確保される環境は、教職としてのやりがいを持続させるための重要な基盤です。
教員の長時間労働が社会問題となる中、組織として健康を守る姿勢を明確に示すことは、採用活動においても大きな強みとなります。実際、ワークライフバランスを重視した勤怠管理を徹底する学校法人では、若手教員の定着率向上や採用志願者数の安定といった好循環が生まれています。
教職員が心身ともに健康であってこそ、質の高い教育を児童生徒に提供できます。デジタル技術を活用し、持続可能な労働環境を整えることで、貴重な教育人材の流出を防ぎましょう。
まとめ|教育機関・学校経営に不可欠な「時間の見える化」で持続可能な学校運営を実現
2026年の労働基準法改正を見据え、教育現場における「時間の見える化」は、もはや先送りできない最優先課題となっています。
給特法を巡る議論や教員不足の深刻化といった状況の中で、勤怠管理システムは単なる記録ツールではなく、学校の持続可能性を支える重要な経営インフラといえるでしょう。
ぜひ本記事で解説した選定ポイントや導入メリットを参考に、自校の文化や運営方針に合ったシステムを選定しましょう。正確なデータに基づく働き方改革を今すぐ始めることで、教育の質と組織運営の双方を高める、持続可能な学校経営の実現につながるはずです。
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