病院・クリニックなど医療業界向け請求書システムおすすめ12選|機能や選び方も解説
医療業界向けでおすすめの請求書システム12選

病院やクリニックでは、部門や取引先によって請求フローが異なるため、自院の運用に合うサービスを見極めましょう。ここでは、医療機関におすすめの請求書システムを紹介します。
サービス名 | おすすめのケース | 請求書発行 | 請求書受領 | 入金管理 | 無料プラン | 無料トライアル |
|---|---|---|---|---|---|---|
Bill One請求書受領 | 請求書の受領・承認・保管をクラウド化したい病院・医療法人 | 〇※ | 〇 | 〇※ | 要問い合わせ | 要問い合わせ |
SVF Cloud | 既存システムのデータから請求書・明細書を出力したい医療機関 | 〇 | - | - | - | 〇 |
BtoBプラットフォーム 請求書 | 請求書の発行・受取をまとめて電子化したい医療法人 | 〇 | 〇 | 〇 | - | 〇 |
請求管理ロボ | 継続請求や法人請求の入金管理まで自動化したい医療機関 | 〇 | - | 〇 | - | 〇 |
freee会計 | 請求書発行と会計処理をまとめて効率化したいクリニック | 〇 | 〇 | 〇 | - | 〇 |
INVOY | 無料から請求書の発行・受取・支払い管理を始めたい小規模クリニック | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
楽楽明細 | 請求書・明細書のWeb発行や郵送代行を活用したい医療機関 | 〇 | - | 〇 | - | 〇 |
ナビエクスプレス | 大量の請求書・通知書・健診関連帳票を電子配信したい医療機関 | 〇 | - | - | 要問い合わせ | 要問い合わせ |
Misoca | 少人数体制で請求書や見積書を手軽に作成したいクリニック | 〇 | - | 〇 | 〇 | 〇 |
board | 案件ごとの見積・請求・売上見込みを管理したい医療法人 | 〇 | - | 〇 | - | 〇 |
MakeLeaps | 請求書の作成・承認・送付・入金管理を一元化したい医療機関 | 〇 | - | 〇 | 〇 | 〇 |
invox受取請求書 | 医薬品・医療材料などの受取請求書処理を自動化したい病院 | - | 〇 | - | - | 〇 |
Bill One請求書受領
【こんな企業におすすめ】
・請求書の発行から受領まで関連業務を効率化したい医療業界の方
・請求書の承認や保管をクラウド管理したい方
・入金管理まで一元管理し経理部門の負担を軽減したい方
Bill One請求書受領は、Sansan株式会社が提供する経理AXサービスです。請求書受領以外にも、経費精算、債権管理などに対応したサービスも提供し、医療機関で発生する請求書関連業務を幅広く効率化できます。
Bill One請求書受領では、医薬品・医療材料、検査委託、設備管理など取引先から届く請求書をオンラインで受領し、AIとオペレーターにより99.9%の精度でデータ化。クラウド上で承認・保管まで管理できるため、紙の請求書処理や部門間の確認作業を削減できます。
また、Bill One債権管理を活用すれば、請求書の作成・発行、入金消込、債権情報の一元管理も可能です。複数拠点を持つ病院や医療法人でも、請求書の受領から発行、入金管理までをまとめて効率化できるサービスです。
- メールサポートあり
- クラウド(SaaS)
- IP制限
- 二要素認証・二段階認証

SVF Cloud
【こんな企業におすすめ】
・導入実績が豊富な請求書システムを安心して導入したい方
・請求書の出力・保管・発行まで一元管理したい医療業界の方
・請求書の出力方法を取引先に合わせて選択できるシステムをお探しの方
SVF Cloudは、ウイングアーク1st株式会社が提供するクラウド型の帳票生成サービスです。帳票生成分野で高いシェアを持ち、4万2,000 社以上に利用されています。
医療機関では、自由診療や企業健診、医療材料・検査委託などに関する請求書、見積書、明細書の作成・出力に活用できます。帳票設計から出力、保管、流通までを一元化でき、ノンプログラミングで帳票の作成・修正が行える点が特徴です。
PDF、Excel、Word、印刷、FAX、メール、電子保管など出力形式も幅広く、取引先や部門ごとに異なる請求書運用にも対応しやすいでしょう。電子帳簿保存法に対応しているほか、通信の暗号化やタイムスタンプ機能も備えており、医療機関の請求書発行・帳票管理を効率化できるサービスです。
- メールサポートあり
- クラウド(SaaS)
- スマホアプリ(Android)対応
- スマホアプリ(iOS)対応

BtoBプラットフォーム 請求書
【こんな企業におすすめ】
・請求書の発行から受領まで関連業務を効率化したい医療業界の方
・紙の請求書のデジタル化に対応できるシステムをお探しの方
・経理業務の負担軽減に請求書システムを活用したい方
BtoBプラットフォーム 請求書は、株式会社インフォマートが提供するクラウド型の電子請求書システムです。請求書の発行・受取を同一システムで管理でき、医薬品・医療材料、検査委託、設備管理、介護・福祉関連サービスなど、医療機関で発生する請求書業務のデジタル化に役立ちます。
デジタル請求書に加え、PDFや紙の請求書も一元管理でき、AI-OCRによるデータ化、承認フロー、会計ソフト連携、仕訳・入金消込の自動化にも対応。請求書の自動発行、メール送信、郵送代行、督促も行えるため、病院や医療法人の経理業務を効率化できます。
電子帳簿保存法やインボイス制度にも対応しており、請求書管理の標準化を進めたい医療機関に適したサービスです。
- 電話サポートあり
- 受領帳票の保存
- メールサポートあり
- JIIMA認証

請求管理ロボ
【こんな企業におすすめ】
・請求書発行や入金管理も対応できるシステムを導入したい医療業界の方
・幅広い決済手段に対応した請求書システムをお探しの方
・会計システムや外部システムと連携して業務効率化を図りたい方
請求管理ロボは、株式会社ROBOT PAYMENTが提供する請求管理・債権管理システムです。1,000社以上の導入実績があり、医療機関では自由診療、企業健診、訪問診療、介護・福祉関連サービス、取引先への請求など、レセプト請求以外の請求業務に活用できます。
請求書の作成・送付、集金・決済管理、入金消込、未入金管理、催促までを自動化できる点が特徴です。クレジットカード、口座振替、コンビニ決済など複数の決済手段に対応し、継続請求や大量請求の処理にも適しています。
会計ソフトや外部システムとの連携、インボイス制度に対応した請求書の発行・保存も可能なため、病院や医療法人の請求から回収までを効率化できるサービスです。
- 電話サポートあり
- 債権管理
- メールサポートあり
- 未入金の自動アラート

freee会計
【こんな企業 におすすめ】
・請求書の発行から受領まで関連業務を効率化したい医療業界の方
・銀行口座やクレジットカード連携に対応したシステムをお探しの方
・法改正やセキュリティ対策がしっかりしたシステムを安心して導入したい方
freee会計は、freee株式会社が提供するクラウド型会計ソフトです。医療機関では、自由診療、企業健診、訪問診療、取引先への請求など、レセプト請求以外の請求書発行や会計処理に活用できます。
請求書の作成・発行、入金確認、消込、記帳まで一元管理でき、銀行口座やクレジットカードとの連携、自動仕訳、AI-OCRによるデータ入力にも対応。売上や費用をリアルタイムで把握できるため、クリニックや医療法人の経営管理にも役立ちます。
法改正にあわせた機能アップデートやセキュリティ対策も備えており、請求書業務と経理業務をまとめて効率化したい医療機関に適したサービスです。
- 電話サポートあり
- 電話サポートあり
- 財務会計
- メールサポートあり

INVOY
【こんな企業におすすめ】
・請求書の発行から受領まで関連業務を効率化したい医療業界の方
・インボイス制度など法制度対応の請求書システムをお探しの方
・経理業務の負荷を軽減したい小規模クリニックや個人経営の医療機関の方
INVOYは、FINUX株式会社が提供するクラウド請求書管理サービスです。医療機関では、自由診療、企業健診、訪問診療、取引先への請求など、レセプト請求以外の請求書作成・発行に活用できます。
請求書や見積書、納品書などを簡単に作成でき、インボイス制度や電子帳簿保存法に対応した運用も可能です。定期的な請求書の自動作成予約、受け取った請求書のデータ化、メール送信、スマートフォンでの管理にも対応。法人口座との自動連携により、入出金明細の取得や資金繰り表の作成も行えます。
freeeやMoney Forwardとの連携にも対応しており、小規模クリニックや個人経営の医療機関で請求書の発行・受取・支払いを効率化したい場合に適したサービスです。
- メールサポートあり
- クラウド(SaaS)
- モバイルブラウザ(スマホブラウザ)対応
- ISMS

楽楽明細
【こんな企業におすすめ】
・既存のシステムと連携して利用できる請求書システムをお探しの方
・幅広い請求書発行に対応できるシステムを導入したい医療業界の方
・専任スタッフのサービスで導入支援をしてほしい方
楽楽明細は、株式会社ラクスが提供するクラウド型の電子請求書発行システムです。病院や医療法人で発生する請求書、納品書、支払明細、領収書などの帳票をWeb上で発行・送付でき、印刷・封入・郵送にかかる作業 を削減できます。
CSVやPDF、API連携に対応しており、既存の販売管理システムや基幹システムを大きく変えずに導入しやすい点が特徴です。Web、メール、郵送代行など送付方法を取引先ごとに選べるため、紙と電子が混在する医療機関の請求業務にも対応可能。
シンプルな操作性や専任スタッフのサポートも備えており、帳票発行を効率化したい医療機関に適したサービスです。
- 電話サポートあり
- JIIMA認証
- メールサポートあり
- 電子帳簿保存法対応

ナビエクスプレス
【こんな企業におすすめ】
・請求書発行業務をデジタル化して発送コストを削減したい医療業界の方
・請求書の未開封を確認して通知できるシステムをお探しの方
・セキュリティのしっかりしたシステムを安心して導入したい方
ナビエクスプレスは、NTTドコモビジネスX株式会社が提供する電子帳票ソリューションです。病院や医療法人で郵送している請求書、明細書、通知書、健診結果帳票などをWeb配信へ切り替え、印刷・封入・発送作業を削減できます。
既存の帳票フォーマットを変えずに利用でき、請求データと宛先情報をCSVで取り込むだけでPDFを自動作成・配信できる点が特徴です。配信後は開封状況を管理画面で確認でき、未開封先へのフォローや帳票の再送にも対応。
ファイルの暗号化、SSL/TLS通信、パスワード設定などのセキュリティ機能も備えています。請求書や健診関連帳票など、大量の帳票送付を効率化したい医療機関に適したサービスです。
- 電話サポートあり
- メールサポートあり